Nidaamka DNA-da ayaa sidoo kale ku xiran awoodeena aan u adeegsan karno electrophoresis si loo kala saaro xeeladaha DNA-ga oo ku kala duwan halbowlaha iyada oo loo eegayo mid ka mid ah labada nin.
Isku-darka DNA
Dhamaadkii 1970, labo farsamooyinka soo-saarista DNA ee lafa-beelka DNA-da ayaa la abuuray. Kuwani waxay ahaayeen habka Sanger (ama didexy) iyo Maxam-Gilbert (habka kiimikada). Habka Maxam-Gilbert wuxuu ku salaysan yahay nukleotide-kala-saaris kiimiko ah waxaana loo isticmaalaa si loo soo koobo oligonucleotide (polymers gaaban gaaban, inta badan ka yar 50 lammaanood oo dherer ah). Nidaamka Sanger waxaa badanaa loo isticmaalaa sababtoo ah waxaa loo xaqiijiyay farsamo ahaan si sahlan oo loo dalbado, iyo, iyadoo la abuurayo PCR iyo farsameynta farsamada, si sahlan ayaa loo adeegsadaa qaybo badan oo DNA ah oo ay ka mid yihiin dhammaan gen. Farsamadani waxay ku salaysan tahay joojinta silsilad by didexynucleotides inta lagu guda jiro falcelinta PCR.
Habka Sanger
Nidaamka Sanger, DNA-da ayaa u faahfaahsan in la falanqeynayo waxaa loo isticmaalaa sida template iyo DNA polymerase loo isticmaalo, ee fal-celinta PCR, si loo abuuro xarriijimo taxadar leh iyadoo la adeegsanayo primers.
Isku darka afar nooc oo PCR ah ayaa loo diyaariyaa, mid kasta oo ka mid ah boqolkiiba qaybood ee didexynucleoside triphosphate (ddNTP) oo la mid ah mid ka mid ah afarta nucleotide (ATP, CTP, GTP ama TTP). Qodobka DNA-ga cusub wuxuu sii wadaa ilaa mid ka mid ah kuwan ka mid ah kuwan la isku daray, wakhtigaas oo la joojin karo.
Dareemid kasta oo PCR wuxuu ku dhamaan doonaa isku dhafka dhererka dhererka kala duwan ee DNA-ga, dhammaantiis oo kudhaca nukleotide ee deyniska lagu calaamadiyay dareen-celintaas. Jel electrophoresis ayaa markaa loo isticmaalaa in lagu kala saaro qaybaha afarta ficil-celinta, afarta afaraad ee kala duwan, iyo in la go'aamiyo taxanaha qaab-dhismeedka asalka ah oo ku saleysan dhererka dhererka dhameeya waxa nukleotide ah.
Dareen-celinta Sanger-ka ee otomaatikada ah, primers ayaa loo isticmaalaa kuwaas oo lagu calaamadiyay afar calaamadood oo kala duwan. Dareenka PCR, marka uu jiro joogitaanka nucleotide didexy kala duwan, ayaa lagu sameeyaa sida kor ku xusan. Si kastaba ha noqotee, marka xigta, afarta arimood ee fal-celinta ayaa markaa la isku daraa laguna dabaqayaa hal jiho oo jel ah. Midabka jajab kasta waxaa lagu ogaanayaa isticmaalka laydhka layska oo xogta waxaa soo uruuriya kombiyuutar kaas oo soo saaraya fhrogrammooyin muujinaya dhirbaaxo midab kasta, kaas oo laga soo xigtay qaabka DNA-da ee loo yaqaan "template DNA".
Caadi ahaan, qaabka isdabajooga ah ayaa si sax ah loogu qiyaaso isugeynta ilaa ugu badnaan qiyaastii 700-800 oo isku-dhafan oo dherer ah. Si kastaba ha noqotee, waxaa suurtogal ah in la helo isugeyn buuxa oo ah unugyada waaweyn iyo, dhab ahaantii, genomes oo dhan, iyadoo la adeegsanayo hababka istiraatiijiga ah sida isugeynta Socodka iyo Shotgun.
Jirada hore , qaybta la shaqeyn karo ee hidda weyn ee soo noqnoqda ayaa soo noqnoqonaya iyada oo la adeegsanayo habka Sanger. Astaamaha cusubi waxaa laga soo saaraa qaybta la isku haleyn karo ee taxanaha ah waxaana loo isticmaalaa in la sii wado jadwalka qaybta hidda ee ka baxsan falcelinta asalka ah.
Isku xirka shotgun ayaa keenaya in si aan kala sooc lahayn loo jaro qaybta DNA ee xiisaha ee jajabyada la xakameyn karo ee loo yaqaan 'regulable', isugeynta jajab kasta, iyo habaynta qaybaha ku saleysan taxadiyada isku dhafan. Farsamadani waxa ay ka dhigtay mid sahlan iyada oo la adeegsanayo software kombuyuutar si loogu diyaariyo qaybaha jajaban.